2012年度
 医学部物理学
■ 当該年度研究業績数一覧表
研究者名 論文 著書 学会発表 その他
発表
和文英文 和文英文 国内国際














影島 賢巳   教授
 0 0 0 0  0 0 0 0  0  0  0  0  0  0
楠本 邦子   准教授
 4 0 0 3  0 0 0 0  3  2  2  0  1  2
新庄 正路   助教
 0 0 1 10  0 0 0 0  2  4  0  0  0  2
 4 0 1 13  0 0 0 0  5  6  2  0  1  4
■ 学術雑誌
原著
1. 竹本邦子, 山本章嗣, 水田 剛, 一瀬 諭, 吉村真史, 難波秀利, 木原 裕:  琵琶湖産の糸状カビ臭産生藍藻Phormidium tenueの細胞内微細構造観察:軟X線顕微鏡と透過型電子顕微鏡および低真空クライオ走査型電子顕微鏡を用いた比較観察.  日本水処理生物学会誌  48 (4) :157-163 , 2012
2. Alexander Timchenko, Sergey Guryanov, Lev Ovchinnikov, Gennady Semisotnov, Masaji Shinjo, Hiroshi Kihara:  Conformation of YB-1 protein at moderate and high ionic strength studied by
SAXS technique.  Photon Factory Activity Report  29 :349 , 2012
総説及び解説
1. Kageshima M.:  Magnetically-modulated atomic force microscopy for analysis of soft matter systems.  Current pharmaceutical biotechnology  13 (14) :2575-2588 , 2012
その他
1. 市村薫, 木原裕:  トランスフェリンとトランスフェリンレセプター.  関西医科大学教養部紀要  32 :39-47 , 2012
2. 竹本 邦子, 池谷 仁里 , 家路 豊成, 太田 俊明 , 木原 裕:  赤外顕微分光法による植物プランクトンの粘着鞘の分析.  立命館大学SRセンターナノテクノロジーネットワーク事業 成果報告書  2011年度 , 2012
3. 竹本 邦子, 水田 剛,一瀬 諭, 吉村 真史, 難波 秀利,木原 裕:  軟X線顕微鏡による植物プランクトン Leptolyngbya tenuis の顆粒の観察 Ⅱ.  立命館大学SRセンターナノテクノロジーネットワーク事業 成果報告書  2011年度 , 2012
4. 竹本 邦子, 馬場 大哉, 中西康次:  XANES測定による琵琶湖底質土の分析.  立命館大学SRセンター先端研究施設共用促進事業 成果報告書  2011年度 , 2012
5. Guryanov SG, Filimonov VV, Timchenko AA, Melnik BS, Kihara H, Kutyshenko VP, Ovchinnikov LP, Semisotnov GV.:  The major mRNP protein YB-1: structural and association properties in solution.  Biochimica et biophysica acta  1834 (2) :559-567 , 2013
6. Matsumura Y, Shinjo M, Matsui T, Ichimura K, Song J, Kihara H.:  Structural study of hNck2 SH3 domain protein in solution by circular dichroism and X-ray solution scattering.  Biophysical chemistry  175-176 :39-46 , 2013
7. Katina N, Timchenko A, Kihara H, Balobanov V, Vasiliev V, Kashparov I, Bychkova V:  Kinetics of mutant apomyoglobin association.  Macromolecular symposia  317-318 (1) :215-226 , 2012
8. Takuji Ohigasi, Haruo Mizutani, Hidetoshi Na,ba, Kuniko Takemoto, and Hiroshi Kihara:  3-Demensional Observation of Cerebral Cortex of Mouse of Using Full-field Imaging Soft X-ray Microscopy.  Memoirs of the SR Center, Ritsumeikan University  14 :169-170 , 2012
9. K. Takemoto, G. Mizuta, M. Yoshimura, S. Ichise, H. Namba and H. Kihara:  Soft x-ray imaging of intracellular structure of Leptolyngbya tenuis (Phormidium tenue) generating musty smell in Lake Biwa.  Memoirs of the SR Center, Ritsumeikan University  14 :171-172 , 2012
10. K. Takemoto, H. Ikegaya, T. Yaji, S. Ichise, T. Ohta and H. Kihara:  Infrared Micro-Spectroscopy Observation of plantplankton with in Lake Biwa.  Memoirs of the SR Center, Ritsumeikan University  14 :173-174 , 2012
11. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Anjali Mahajan, Ming-Daw Tsai and Hiroshi Kihara:  Time-resolved SAXS on Ki67 FHA domain refolding at cryo conditions.  Photon Factory Activity Report  28 :245 , 2012
12. Zie-jie Qin, Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Hiroshi Kihara:  Structural analysis of α-helix rich intermediate of bovine β-lactoglobulin on its folding pathway.  Photon Factory Activity Report  28 :246 , 2012
13. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Nobuyuki Okishio and Hiroshi Kihara:  Time-resolved kinetic refolding of PI3K SH3 in the presence of 45% ethylene glycol at pH 6.  Photon Factory Activity Report  28 :247 , 2012
14. Alexander Timchenko, Valentina Bychkova, Vitaly Balobanov, Anna Egorova, Kazumoto Kimura, Hiroshi Kihara:  Formation of amyloid-like particles by albebetin-thioredoxin fused protein and its H65F, H30F mutant forms studied by SAXS technique.  Photon Factory Activity Report  28 :274 , 2012
15. Alexander Timchenko, Sergey Guryanov, Lev Ovchinnikov, Igor Serdyuk, Kazumoto Kimura, Hiroshi Kihara:  Kinetics of amyloid-like particle formation by YB-1 protein and its truncated variants studied by SAXS technique.  Photon Factory Activity Report  28 :275 , 2012
16. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Tsutomu Matsui, Kaoru Ichimura, Jianxing Song and Hiroshi Kihara:  Structural study of hNck2 SH3 domain protein by X-ray solution scattering III. Structure of hNck2 SH3 domain at pH 2.  Photon Factory Activity Report  29 :365 , 2012
17. Masaji Shinjo, Yoshitaka Matsumura, Kaoru Ichimura, Jianxing Song and Hiroshi Kihara,:  Structural study of hNck2 SH3 domain protein by X-ray solution scattering IV. Structural analysis of hNck2 SH3 domain at pH 2 and pH 6: non-native alpha-helix-rich monomer and native dimer.  Photon Factory Activity Report  29 :366 , 2012
18. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Tsutomu Matsui, Kaoru Ichimura, Jianxing Song and Hiroshi Kihara:  Structural study of hNck2 SH3 domain protein by X-ray solution scattering II. pH-dependent structural change.  Photon Factory Activity Report  29 :367 , 2012
19. Yoshitaka Matsumura, Tsutomu Matsui, Kaoru Ichimura, Jianxing Song and Hiroshi Kihara:  Structural study of hNck2 SH3 domain protein by X-ray solution scattering I. Concentration dependence at pH 6.  Photon Factory Activity Report  29 :368 , 2012
20. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Anjali Mahajan, Ming-Daw Tsai and Hiroshi Kihara:  Time-resolved SAXS on FHA1 domain of Rad53 refolding at cryo conditions.  Photon Factroy Activity Report  28 :244 , 2012
21. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Nobuyuki Okishio and Hiroshi Kihara:  Unfolding of PI3K SH3 in the presence of 45% ethylene glycol at pH 6.  Photon Factroy Activity Report  28 :248 , 2012
22. Masaji Shinjo, Yasumasa Morimoto, Masaki Kojima, Jinsong Li, Xianju Jin, Yoshitaka Matsumura, Hiroshi Kihara:  Structural analysis of srcSH3 intermediate on its folding pathway.  Photon Factory Activity Report  28 :242 , 2012
■ 学会発表
国際学会及び海外の学会
1. Masami Kageshima, Yutaka Mera, Koji Maeda: Differential charge amplifier for detection of optomechanical interaction with quartz force sensor.  20th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy,  那覇,  2012/12
2. Kuniko Takemoto, Go Mizuta, Akitsugu Yamamoto, Masashi Yoshimura, Satoshi Ichise, Hidetoshi Namba and Hiroshi Kihara: Soft X-ray Imaging of Intracellular Granules in Filamentous Cyanobacterium.  11th International Conference on X-ray Microscopy,  Shanghai,  2012/08
3. Kuniko Takemoto, Kishin Usui, Takuji Ohigashi, Hiroki Fujii, Masashi Yoshimura, Hidetoshi Namba and Hiroshi Kihara: Improvement of Cryogenic 3-Dimensional Observation System of Soft X-ray Microscope at the SR Center of Ritsumeikan University.  11th International Conference on X-ray Microscopy,  Shanghai,  2012/08
全国規模の学会
1. 吉村真史, 竹本邦子, 大東琢治, 木原裕, 難波秀利, 太田俊明: 軟X線顕微鏡による軽元素マッピング.  日本放射光学会,  名古屋市,  2013/01
2. 竹本邦子, 吉村真史, 大東琢治, 臼井規真, 難波秀利, 木原 裕: 結像型軟X線顕微鏡試料システム.  日本放射光学会,  名古屋市,  2013/01
3. 松村義隆, 新庄正路, 松井つとむ, 市村薫, Jianxing Song, 木原裕: X線溶液散乱によるhNck2 SH3 domain蛋白質の構造研究 その1, (1P-21, 8/27).  第21会日本バイオイメージング学会学術集会,  京都市,  2012/08
4. 松村義隆, 新庄正路, 松井つとむ, 市村薫, Jianxing Song, 木原裕: X線溶液散乱によるhNck2 SH3 domain蛋白質の構造研究 その2, (1P-22, 8/27).  第21会日本バイオイメージング学会学術集会,  京都市,  2012/08
5. 新庄正路, 森本康幹, 小島正樹, Jinsong Li, Xianju Jin, 松村義隆, 木原裕: src SH3ドメインにおける初期フォールディング中間体の構造解析 II -Local Minimum構造の探索-, (1P-20, 8/27).  第21会日本バイオイメージング学会学術集会,  京都市,  2012/08
6. 竹本邦子, 一瀬 諭, 池谷仁里, 大東琢治, 難波秀利, 木原裕: 軟X線顕微鏡によるピコ植物プランクトンの粘質鞘の解析.  第21回 日本バイオイメージング学会,  京都市,  2012/08
7. 竹本邦子, 山本章嗣, 水田 豪, 吉村真史, 一瀬 諭, 難波秀利, 木原 裕: 軟X線顕微鏡による糸状植物プランクトンの細胞内顆粒の観察.  第21回 日本バイオイメージング学会,  京都市,  2012/08
8. 木原 裕, 竹本邦子, 大東琢治, 渡辺信久, 高嶋圭史, 保坂將人: 生きた細胞の動きを観測する軟X線顕微鏡の開発.  第21回 日本バイオイメージング学会,  京都市,  2012/08
9. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Kaoru Ichimura, Tsutomu Matsui, Jianxing Song and Hiroshi Kihara: Structural features of hNck2 SH3 domain, (1P-018, 6/20).  第12回日本蛋白質科学会年会,  名古屋市,  2012/06
10. ◎Masaji Shinjo, Yoshitaka Matsumura, Kaoru Ichimura, Jianxing Song, Hiroshi Kihara: Structural analysis of hNck2 SH3 domain at various pH: non-native α-helix-rich monomer and native dimer.  第50回日本生物物理学会年会,  名古屋市,  2012/09
11. ◎Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Tsutomu Matsui, Kaoru Ichimura, Jianxing Song, Hiroshi Kihara: Structural properties and folding process of hNck2 SH3 domain.  第50回日本生物物理学会年会,  名古屋市,  2012/09
その他
1. 影島賢巳: 原子間力顕微鏡を用いた動的物性計測の新展開.  第9回バイオプティクス研究会,  山口,  2012/12
2. 影島賢巳: 原子間力顕微鏡を用いた微視的ソフトマター系粘弾性計測のその後の展開.  第1回「さきがけその後」研究懇話会,  京都,  2012/11
3. 竹本邦子: 軟X線顕微鏡で微生物を観る.  プレ戦略イニシアティブ(研究拠点提案型) 「生物機能の高度化を目指した応用微生物研究拠点」第3回セミナー,  つくば市,  2012/09
4. Yoshitaka Matsumura, Masaji Shinjo, Tsutomu Matsui, Kaoru Ichimura, Jingxiang Liu, Jianxing Song and Hiroshi Kihara: Equilibrium expanded non-native alpha-helix intermediate of hNck2 SH3 domain at acidic pH.  The 6th International Symposium “Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions”,  京都,  2012/12
5. Yoshitaka Matsumura, Xianju Jin, Masaji Shinjo, Shinichi Kimura and Hiroshi Kihara: Teraherz spectroscopy of proteins by synchrotron radiation at UVSOR.  The 6th International Symposium “Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions”,  京都,  2012/12
6. 吉村真史, 臼井規真, 大東琢治, 竹本邦子, 難波秀利, 木原裕: BL-12結像型軟X線顕微鏡ビームライン.  立命館大学SRセンター成果報告会,  草津市,  2012/06
7. 竹本邦子, 水田剛, 山本章嗣, 吉村真史, 一瀬諭, 大東琢治, 難波秀利, 木原裕: 琵琶湖のカビ臭原因糸状体シアノバクテリア (Phormidium tenue)の細胞内顆粒の観察.  立命館大学SRセンター成果報告会,  草津市,  2012/06